“女娲”基因组计划发布第六项成果
栏目:行业动态 发布时间:2024-12-09 17:13
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中国迷信院生物物理研讨所徐涛院士团队、何顺平易近研讨员团队牵头的“女娲”中国人群基因组打算宣布了第六项结果,应用140多个国度跟地域的8222例精深度全基因组测序数据,构建了寰球人群VNTR多态性遗传图谱(编者注:VNTR为可变数量串联反复序列)。相干论文11月27日宣布于《细胞-基因组学》(Cell Genomics)。在人类基因组中,超越一半的地区由反复序列构成。这些反复序列在人类退化进程中高度变更,极年夜地丰盛了基因组的遗传多样性。可变数量串联反复序列又被称为“小卫星DNA”,是一类反复基序(motif)超越6 bp(base pair),反复次数平日在10-60次的DNA串联序列。已有研讨标明VNTR不只能够经由过程长度扩增来增添抱病危险,其反复基序的变更也具有自力的致病效应。但是受限于样本量、测序深度、人群多样性及辨认算法等要素,在已有的人群范围的基因组测序名目中,VNTR的遗传研讨还远远缺乏,招致了人类基因组中局部遗传力的“缺掉”。研讨宣布的“女娲”VNTR多态性图谱,实现了“女娲”基因组资本对人类基因组中重要反复序列元件的全笼罩(ME,STR跟VNTR),是体系剖析反复序列元件变异的主要参考。该任务拓展了现有遗传研讨中反复序列元件变异范围,为咱们懂得反复序列元件在基因调控中的感化供给了新的视角,并为将来的临床研讨跟基因型-表型关系研讨供给了主要参考。此前,“女娲”基因组名目基于年夜范围人群全基因组测序数据,曾经宣布跟剖析了人类基因组SNP、InDel变异图谱,挪动元件变异图谱跟微卫星变异图谱,并基于基因组中的近期正抉择及非编码调控元件顺应性抉择,探究了其对人类表型跟疾病演变的影响。相干论文信息:https://doi.org/10.1016/j.xgen.2024.100699   申明:新浪网独家稿件,未经受权制止转载。 -->
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